包皮过长是发生阴茎癌的“病根子”。包皮垢的大危险是可能使阴茎头发生癌变，另外阴茎头包皮炎反复发作也是引起阴茎癌的重要因素。长期的阴茎包皮内的细菌、病毒、脱落的上皮细胞等污垢的刺激，会使阴茎癌的发病机会增加。在我国，阴茎癌的发病率相当高，约占男性泌尿生殖系统肿瘤的一半。而阴茎癌90%以上都发生于包皮过长的人。发病年龄比大多数癌症早。甚至20岁以前也可以发生。因为包皮过长在男子中相当普遍，而且不少人缺乏生理卫生知识，不注意经常翻开包皮清洗，这就增加了阴茎癌的发病率。

包皮过长者，阴茎的卫生清治很难经常做好，包皮内隐藏的细菌或病毒以及包皮垢，往往可以在性生活时侵入女性生殖道内，引起女性的感染，甚至引发子宫颈癌。同时，由于包皮垢的长期刺激，可引起包皮和阴茎头发炎，严重者可因炎症而引起龟头与包皮粘连。一旦出现这些病症，必然会在性生活时引起性交痛，可能导致性生活不和谐或心因性性功能障碍。

早期包皮环切术是治疗包皮过长的有效方法，手术的时间可选择在婚前，如果包皮过长，但包皮口宽大，易于上翻，也可暂不手术，但应经常上翻清洗，保持局部清洁。

有些人认为包茎和包皮过长是一回事，这是不对的。包茎是指包皮口狭小，包皮难以上翻者。判断是包茎还是包皮过长，可以通过自我检查进行确定，方法是：在阴茎部涂搽肥皂，使包皮内外润滑，左手固定阴茎，右手将包皮向后推并翻转，若能顺利将包皮上翻，为包皮过长;若包皮口太小不能上翻，即为包茎。

包茎多数为先天性。有一部分是在包皮过长的基础上反复感染，造成粘连不能翻起所致。

包茎比起包皮过长来对人身体的危害要大得多。有些严重的包茎，包皮口窄如针孔，排尿时包皮鼓起如球，排尿不畅。由于包茎、尿道口的狭窄、排尿时膀胱括约肌收缩。膀胱内压在克服尿道阻力之前或同时，也超过了膀胱毛氏鞘所能承受的压力，尿液沿输尿管返流，输尿管、肾盂扩张，引起上尿路细菌感染，疤痕形成，而导致继发性反流性肾脏病甚至肾功能损害。